Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab3bQ9CZT8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms