Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atxn3Q9CVD2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atxn3Q9CVD2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms