Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl28Q9CR40 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms