Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZYG11BQ9C0D3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZYG11BQ9C0D3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZYG11BQ9C0D3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZYG11BQ9C0D3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZYG11BQ9C0D3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZYG11BQ9C0D3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZYG11BQ9C0D3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZYG11BQ9C0D3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZYG11BQ9C0D3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZYG11BQ9C0D3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZYG11BQ9C0D3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms