Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRCC1Q9C099 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRCC1Q9C099 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms