Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Reep3Q99KK1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Reep3Q99KK1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms