Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl22Q99JN2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhl22Q99JN2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms