Protein–RNA interactions for Protein: Q96S96

PEBP4, Phosphatidylethanolamine-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEBP4Q96S96 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEBP4Q96S96 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEBP4Q96S96 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms