Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC3BQ96NL0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUNDC3BQ96NL0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms