Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM20AQ96MK3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM20AQ96MK3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms