Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCMTD1Q96MG8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCMTD1Q96MG8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms