Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMX3Q96JJ7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMX3Q96JJ7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms