Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SGF29Q96ES7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SGF29Q96ES7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms