Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD4Q96DM1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGBD4Q96DM1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms