Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BRF1Q92994 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRF1Q92994 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRF1Q92994 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms