Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
RAD50Q92878 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAD50Q92878 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms