Protein–RNA interactions for Protein: Q920B9

Supt16h, FACT complex subunit SPT16, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt16hQ920B9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Supt16hQ920B9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Supt16hQ920B9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Supt16hQ920B9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Supt16hQ920B9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Supt16hQ920B9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Supt16hQ920B9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Supt16hQ920B9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Supt16hQ920B9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Supt16hQ920B9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Supt16hQ920B9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Supt16hQ920B9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Supt16hQ920B9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Supt16hQ920B9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Supt16hQ920B9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms