Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klhdc3Q8VEM9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhdc3Q8VEM9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhdc3Q8VEM9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms