Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC56

FAM71B, Protein FAM71B, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71BQ8TC56 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM71BQ8TC56 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM71BQ8TC56 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms