Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r200Q8R281 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms