Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEA6

GLIS3, Zinc finger protein GLIS3, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3Q8NEA6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GLIS3Q8NEA6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GLIS3Q8NEA6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLIS3Q8NEA6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLIS3Q8NEA6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLIS3Q8NEA6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLIS3Q8NEA6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GLIS3Q8NEA6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLIS3Q8NEA6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLIS3Q8NEA6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLIS3Q8NEA6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLIS3Q8NEA6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLIS3Q8NEA6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GLIS3Q8NEA6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms