Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPAP2Q8IXW5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPAP2Q8IXW5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPAP2Q8IXW5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms