Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC9A9Q8IVB4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9A9Q8IVB4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms