Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef8Q8CE24 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pramef8Q8CE24 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.8 ms