Protein–RNA interactions for Protein: Q86U37

LINC01551, Uncharacterized protein encoded by LINC01551, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01551Q86U37 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01551Q86U37 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01551Q86U37 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms