Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1S5

CHST9, Carbohydrate sulfotransferase 9, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST9Q7L1S5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHST9Q7L1S5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST9Q7L1S5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST9Q7L1S5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST9Q7L1S5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST9Q7L1S5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST9Q7L1S5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST9Q7L1S5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST9Q7L1S5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHST9Q7L1S5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST9Q7L1S5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST9Q7L1S5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST9Q7L1S5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST9Q7L1S5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST9Q7L1S5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHST9Q7L1S5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST9Q7L1S5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST9Q7L1S5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST9Q7L1S5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST9Q7L1S5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST9Q7L1S5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST9Q7L1S5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST9Q7L1S5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHST9Q7L1S5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms