Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GBP6Q6ZN66 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GBP6Q6ZN66 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP6Q6ZN66 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms