Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcp4l1Q6W8Q3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcp4l1Q6W8Q3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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