Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox19Q62249 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox19Q62249 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox19Q62249 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox19Q62249 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox19Q62249 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox19Q62249 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox19Q62249 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox19Q62249 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox19Q62249 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox19Q62249 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox19Q62249 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox19Q62249 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox19Q62249 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox19Q62249 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox19Q62249 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox19Q62249 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox19Q62249 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms