Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Foxd3Q61060 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd3Q61060 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms