Protein–RNA interactions for Protein: Q61011

Gnb3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb3Q61011 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gnb3Q61011 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb3Q61011 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb3Q61011 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb3Q61011 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb3Q61011 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb3Q61011 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb3Q61011 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb3Q61011 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb3Q61011 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb3Q61011 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb3Q61011 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb3Q61011 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb3Q61011 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb3Q61011 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gnb3Q61011 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnb3Q61011 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnb3Q61011 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnb3Q61011 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnb3Q61011 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnb3Q61011 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnb3Q61011 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnb3Q61011 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnb3Q61011 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnb3Q61011 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnb3Q61011 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnb3Q61011 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnb3Q61011 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gnb3Q61011 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms