Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTQ0

TTC39B, Tetratricopeptide repeat protein 39B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39BQ5VTQ0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTC39BQ5VTQ0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC39BQ5VTQ0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms