Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ckap2Q3V1H1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ckap2Q3V1H1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ckap2Q3V1H1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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