Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWL2

Pip4p1, Type 1 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 4-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4p1Q3TWL2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pip4p1Q3TWL2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms