Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC96Q2M329 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC96Q2M329 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
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