Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USF2Q15853 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USF2Q15853 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USF2Q15853 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USF2Q15853 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USF2Q15853 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USF2Q15853 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USF2Q15853 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USF2Q15853 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USF2Q15853 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USF2Q15853 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USF2Q15853 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USF2Q15853 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USF2Q15853 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USF2Q15853 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USF2Q15853 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USF2Q15853 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USF2Q15853 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USF2Q15853 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USF2Q15853 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USF2Q15853 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USF2Q15853 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USF2Q15853 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USF2Q15853 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
USF2Q15853 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USF2Q15853 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USF2Q15853 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
USF2Q15853 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USF2Q15853 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USF2Q15853 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USF2Q15853 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USF2Q15853 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USF2Q15853 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USF2Q15853 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USF2Q15853 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USF2Q15853 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USF2Q15853 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USF2Q15853 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USF2Q15853 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USF2Q15853 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USF2Q15853 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USF2Q15853 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USF2Q15853 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USF2Q15853 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USF2Q15853 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USF2Q15853 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USF2Q15853 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USF2Q15853 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USF2Q15853 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USF2Q15853 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USF2Q15853 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USF2Q15853 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USF2Q15853 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USF2Q15853 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USF2Q15853 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USF2Q15853 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USF2Q15853 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USF2Q15853 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USF2Q15853 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USF2Q15853 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USF2Q15853 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USF2Q15853 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USF2Q15853 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USF2Q15853 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USF2Q15853 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USF2Q15853 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USF2Q15853 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USF2Q15853 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USF2Q15853 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
USF2Q15853 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USF2Q15853 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USF2Q15853 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USF2Q15853 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USF2Q15853 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USF2Q15853 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USF2Q15853 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USF2Q15853 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USF2Q15853 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USF2Q15853 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USF2Q15853 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
USF2Q15853 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
USF2Q15853 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USF2Q15853 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USF2Q15853 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USF2Q15853 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USF2Q15853 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USF2Q15853 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USF2Q15853 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USF2Q15853 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USF2Q15853 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
USF2Q15853 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USF2Q15853 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USF2Q15853 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USF2Q15853 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USF2Q15853 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USF2Q15853 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
USF2Q15853 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
USF2Q15853 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
USF2Q15853 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USF2Q15853 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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