Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALX1Q15699 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
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