Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1AQ15573 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1AQ15573 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TAF1AQ15573 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
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