Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TCEA2Q15560 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TCEA2Q15560 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms