Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NR1H3Q13133 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR1H3Q13133 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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