Protein–RNA interactions for Protein: Q12196

RIO1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIO1Q12196 UBP14YBR058C 2346 nt3.16□□□□□ -1.9
RIO1Q12196 TRM13YOL125W 1431 nt3.16□□□□□ -1.9
RIO1Q12196 PCL10YGL134W 1302 nt3.16□□□□□ -1.9
RIO1Q12196 GCD6YDR211W 2139 nt3.16□□□□□ -1.9
RIO1Q12196 PUF2YPR042C 3228 nt3.15□□□□□ -1.9
RIO1Q12196 ERG26YGL001C 1050 nt3.15□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 YGR015CYGR015C 987 nt3.15□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 OKP1YGR179C 1221 nt3.15□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 COX23YHR116W 456 nt3.15□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 YBR053CYBR053C 1077 nt3.15□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 DIM1YPL266W 957 nt3.15□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 POL3YDL102W 3294 nt3.15□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 SDS23YGL056C 1584 nt3.15□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 RAD7YJR052W 1698 nt3.14□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 ISW2YOR304W 3363 nt3.14□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 PGS1YCL004W 1566 nt3.14□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 ATG13YPR185W 2217 nt3.14□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 YDL162CYDL162C 357 nt3.14□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 ERP1YAR002C-A 660 nt3.14□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 DGA1YOR245C 1257 nt3.14□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 YPL107WYPL107W 747 nt3.14□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 SMP3YOR149C 1551 nt3.13□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 COS7YDL248W 1152 nt3.13□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 TIM21YGR033C 720 nt3.13□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 MRPS35YGR165W 1038 nt3.13□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 COS5YJR161C 1152 nt3.13□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 PIR1YKL164C 1026 nt3.13□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 SPC34YKR037C 888 nt3.13□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 YNR071CYNR071C 1029 nt3.13□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 GWT1YJL091C 1473 nt3.13□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 CNA1YLR433C 1662 nt3.13□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 MSB2YGR014W 3921 nt3.13□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 ITC1YGL133W 3795 nt3.13□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 IMH1YLR309C 2736 nt3.13□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 WHI4YDL224C 1950 nt3.12□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 SIR1YKR101W 1965 nt3.12□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 YIL169CYIL169C 2988 nt3.12□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 DTD1YDL219W 453 nt3.12□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 BMH2YDR099W 822 nt3.12□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 COS12YGL263W 1143 nt3.12□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 RPS23AYGR118W 438 nt3.12□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 YJL175WYJL175W 513 nt3.12□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 EMG1YLR186W 759 nt3.12□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 YLR230WYLR230W 306 nt3.12□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 YLR297WYLR297W 390 nt3.12□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 YPR015CYPR015C 744 nt3.12□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 RPS23BYPR132W 438 nt3.12□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 YIL092WYIL092W 1902 nt3.12□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 RAX2YLR084C 3663 nt3.12□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 HEH2YDR458C 1992 nt3.12□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 FRE2YKL220C 2136 nt3.11□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 NPL4YBR170C 1743 nt3.11□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 YEL028WYEL028W 462 nt3.11□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 YKR047WYKR047W 306 nt3.11□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 PSR1YLL010C 1284 nt3.11□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 snR42snR42 351 nt3.11□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 ARO4YBR249C 1113 nt3.11□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 YPL216WYPL216W 3309 nt3.11□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 ERG11YHR007C 1593 nt3.11□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 TFC4YGR047C 3078 nt3.11□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 TRE2YOR256C 2430 nt3.1□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 YAT2YER024W 2772 nt3.1□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 BPT1YLL015W 4680 nt3.1□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 IMG2YCR071C 441 nt3.1□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 YPR1YDR368W 939 nt3.1□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 MRS3YJL133W 945 nt3.1□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 RPS31YLR167W 459 nt3.1□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 RPL6AYML073C 531 nt3.1□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 KRE2YDR483W 1329 nt3.1□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 CCM1YGR150C 2595 nt3.09□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 RSN1YMR266W 2862 nt3.09□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 YGL214WYGL214W 486 nt3.09□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 PPX1YHR201C 1194 nt3.09□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 YLR462WYLR462W 609 nt3.09□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt3.09□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 UTP25YIL091C 2166 nt3.09□□□□□ -1.91
RIO1Q12196 SPS2YDR522C 1509 nt3.09□□□□□ -1.92
RIO1Q12196 YBR138CYBR138C 1575 nt3.08□□□□□ -1.92
RIO1Q12196 SUP56tL(CAA)A 82 nt3.08□□□□□ -1.92
RIO1Q12196 SUP53tL(CAA)C 82 nt3.08□□□□□ -1.92
RIO1Q12196 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.08□□□□□ -1.92
RIO1Q12196 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.08□□□□□ -1.92
RIO1Q12196 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.08□□□□□ -1.92
RIO1Q12196 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.08□□□□□ -1.92
RIO1Q12196 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.08□□□□□ -1.92
RIO1Q12196 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.08□□□□□ -1.92
RIO1Q12196 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.08□□□□□ -1.92
RIO1Q12196 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.08□□□□□ -1.92
RIO1Q12196 SPO12YHR152W 522 nt3.08□□□□□ -1.92
RIO1Q12196 SEC65YML105C 822 nt3.08□□□□□ -1.92
RIO1Q12196 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt3.08□□□□□ -1.92
RIO1Q12196 PEX11YOL147C 711 nt3.08□□□□□ -1.92
RIO1Q12196 MET16YPR167C 786 nt3.08□□□□□ -1.92
RIO1Q12196 NEM1YHR004C 1341 nt3.08□□□□□ -1.92
RIO1Q12196 RPA190YOR341W 4995 nt3.08□□□□□ -1.92
RIO1Q12196 MIG1YGL035C 1515 nt3.08□□□□□ -1.92
RIO1Q12196 SRC1YML034W 2505 nt3.08□□□□□ -1.92
RIO1Q12196 RGC1YPR115W 3252 nt3.07□□□□□ -1.92
RIO1Q12196 CEX1YOR112W 2286 nt3.07□□□□□ -1.92
RIO1Q12196 EPL1YFL024C 2499 nt3.07□□□□□ -1.92
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