Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms