Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLFN5Q08AF3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLFN5Q08AF3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms