Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cdx4Q07424 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cdx4Q07424 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cdx4Q07424 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cdx4Q07424 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cdx4Q07424 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cdx4Q07424 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cdx4Q07424 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cdx4Q07424 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdx4Q07424 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdx4Q07424 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdx4Q07424 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdx4Q07424 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cdx4Q07424 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cdx4Q07424 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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