Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNG1Q06432 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG1Q06432 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms