Protein–RNA interactions for Protein: Q05027

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, yeastyeast

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAF9Q05027 YOR314WYOR314W 330 nt3.33□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 BMT2YBR141C 1014 nt3.33□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 snR42snR42 351 nt3.33□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 MNR2YKL064W 2910 nt3.33□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 YHR080CYHR080C 4038 nt3.32□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 DET1YDR051C 1005 nt3.32□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 YGR219WYGR219W 342 nt3.32□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 DOG2YHR043C 741 nt3.32□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt3.32□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 RRP5YMR229C 5190 nt3.32□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 YMR018WYMR018W 1545 nt3.31□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 MCM21YDR318W 1107 nt3.31□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 YJL175WYJL175W 513 nt3.31□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 RPL18AYOL120C 561 nt3.31□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 TMC1YOR052C 453 nt3.31□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 YOR186WYOR186W 435 nt3.31□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 CMD1YBR109C 444 nt3.31□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 YMR1YJR110W 2067 nt3.31□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 GCD1YOR260W 1737 nt3.3□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 PEP7YDR323C 1548 nt3.3□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 POL31YJR006W 1464 nt3.3□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 ABD1YBR236C 1311 nt3.3□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 DUO1YGL061C 744 nt3.3□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 ARC15YIL062C 465 nt3.3□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 YUH1YJR099W 711 nt3.3□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 CDC73YLR418C 1182 nt3.3□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 TRI1YMR233W 681 nt3.3□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 CHS2YBR038W 2892 nt3.3□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 ULP1YPL020C 1866 nt3.3□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 YHR202WYHR202W 1809 nt3.3□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 APL4YPR029C 2499 nt3.3□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 MET10YFR030W 3108 nt3.29□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 VPS27YNR006W 1869 nt3.29□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 MSS2YDL107W 1056 nt3.29□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt3.29□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt3.29□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt3.29□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt3.29□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 PHM6YDR281C 315 nt3.29□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.29□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 ERV29YGR284C 933 nt3.29□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 YPT35YHR105W 645 nt3.29□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 DLS1YJL065C 504 nt3.29□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 RUF21RUF21 707 nt3.29□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 TMA16YOR252W 537 nt3.29□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 MCD4YKL165C 2760 nt3.29□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 UBP12YJL197W 3765 nt3.29□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 FAR1YJL157C 2493 nt3.28□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 FLO5YHR211W 3228 nt3.28□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 IRC6YFR043C 714 nt3.28□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 AHP1YLR109W 531 nt3.28□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 SPS4YOR313C 1017 nt3.28□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 GCN1YGL195W 8019 nt3.28□□□□□ -1.88
TAF9Q05027 MAL12YGR292W 1755 nt3.28□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 MAL32YBR299W 1755 nt3.28□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 NTO1YPR031W 2247 nt3.27□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 STU1YBL034C 4542 nt3.27□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 MED2YDL005C 1296 nt3.27□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 NSE3YDR288W 912 nt3.27□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 EDC1YGL222C 528 nt3.27□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt3.27□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 PAN5YHR063C 1140 nt3.27□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 MSA2YKR077W 1092 nt3.27□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 ARG80YMR042W 534 nt3.27□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 MRPL16YBL038W 699 nt3.27□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 RPS7AYOR096W 573 nt3.27□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 TAF14YPL129W 735 nt3.27□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 RRN7YJL025W 1545 nt3.27□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 PRS5YOL061W 1491 nt3.27□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 STE23YLR389C 3084 nt3.27□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 TRM1YDR120C 1713 nt3.27□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 PRP3YDR473C 1410 nt3.27□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 QRI7YDL104C 1224 nt3.26□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.26□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.26□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 PDX1YGR193C 1233 nt3.26□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt3.26□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 ERG2YMR202W 669 nt3.26□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 snR17asnR17a 333 nt3.26□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 MCM16YPR046W 546 nt3.26□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 MIG3YER028C 1185 nt3.25□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 YGR149WYGR149W 1299 nt3.25□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 PEX21YGR239C 867 nt3.25□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 BET1YIL004C 429 nt3.25□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 MAK16YAL025C 921 nt3.25□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 RPN13YLR421C 471 nt3.25□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 RPL20BYOR312C 519 nt3.25□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 FDH2YPL275W 711 nt3.25□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 YPS6YIR039C 1614 nt3.25□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 JJJ1YNL227C 1773 nt3.25□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 VPS17YOR132W 1656 nt3.24□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 HAT2YEL056W 1206 nt3.24□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 VFA1YER128W 612 nt3.24□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 SCM4YGR049W 564 nt3.24□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 MRPS35YGR165W 1038 nt3.24□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 YLR297WYLR297W 390 nt3.24□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt3.24□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 MDJ2YNL328C 441 nt3.24□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 SIL1YOL031C 1266 nt3.24□□□□□ -1.89
TAF9Q05027 NMD2YHR077C 3270 nt3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.8 ms