Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox13Q04891 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox13Q04891 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox13Q04891 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox13Q04891 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox13Q04891 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox13Q04891 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox13Q04891 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox13Q04891 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox13Q04891 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sox13Q04891 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sox13Q04891 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sox13Q04891 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sox13Q04891 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sox13Q04891 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sox13Q04891 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox13Q04891 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms