Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ACVR1Q04771 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACVR1Q04771 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms