Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msx2Q03358 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Msx2Q03358 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms