Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SKOR1P84550 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKOR1P84550 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms